Avec virtualdub c'est assez simple mais il te faut le codec LameACM
tu peux le télécharger ici :
http://damien.racca.free.fr/sauvgard/vhs.html
Tu l'installe (clic droit sur LameACM.inf -> installer)
Ensuite tu ouvres ta video avec virtualdub, tu met la video en "direct stream copy".
Tu met le son en "Full processing", tu cliques sur "compression", tu choisi le codec LameACM (Lame MP3), tu choisi le débit (par exemple 128 kbits ou 96 kbits en 44 100 Hz stéréo CBR) et tu clique OK
Ensuite tu fais "File -> save as AVI" tu choisi un nom (n'écrase pas ton fichier actuel) et tu balance, ça va tourner tout seul et au final tu auras ta video avec le son réencodé.
Tu refais de même avec l'autre portion de ta video.
Une fois que tu as tes 2 portions tu devrais pouvoir les recoller en ouvrant la première avec virtualdub puis en faisant "File -> append avi segment"
Puis tu passe la video en "direct stream copy" et tu sauvegarde en faisant "File -> save as avi"